GABPA

GABPA
Dostępne konstrukcje WPB Wyszukiwanie ortologów: Lista kodów identyfikacyjnych PDB
Identyfikatory
	, E4TF1-60, E4TF1A, NFT2, NRF2, NRF2A, RCH04A07, podjednostka alfa czynnika transkrypcyjnego białka wiążącego GA, podjednostka alfa czynnika transkrypcyjnego białka wiążącego GA
Identyfikatory zewnętrzne
Lokalizacja genu ( człowiek ) Chr. Zespół Początek Koniec
Lokalizacja genu ( mysz ) Chr. Zespół Początek Koniec
Wzór ekspresji RNA Błagam Człowiek Mysz (ortolog) BioGPS
Ontologia genów Funkcja molekularna Komponent komórkowy Proces biologiczny Źródła: Amigo / QuickGO
ortologi Gatunek Człowiek Mysz Entrez Ensembl UniProt RefSeq (mRNA) RefSeq (białko) Lokalizacja (UCSC) PubMed search
Wikidane
Wyświetl/edytuj człowieka Wyświetl/edytuj mysz

Łańcuch alfa białka wiążącego GA jest białkiem , które u ludzi jest kodowane przez gen GABPA .

Funkcjonować

Ten gen koduje jedną z trzech podjednostek czynnika transkrypcyjnego białka wiążącego GA, która działa jako podjednostka wiążąca DNA. Ponieważ ta podjednostka jest identyczna z podjednostką kodującą gen jądrowego czynnika oddechowego 2, prawdopodobnie bierze udział w aktywacji ekspresji oksydazy cytochromowej i jądrowej kontroli funkcji mitochondriów. Podjednostka ta jest również identyczna z podjednostką stanowiącą czynnik transkrypcyjny E4TF1, odpowiedzialny za ekspresję genu E4 adenowirusa. Ze względu na lokalizację chromosomalną i zdolność do tworzenia heterodimerów z innymi polipeptydami, gen ten może odgrywać rolę w fenotypie zespołu Downa.

Interakcje

Wykazano, że GABPA oddziałuje z czynnikiem C1 komórki gospodarza , czynnikiem transkrypcyjnym Sp1 i czynnikiem transkrypcyjnym Sp3 .

Dalsza lektura

•   Chrast R, Chen H, Morris MA, Antonarakis SE (lipiec 1995). „Mapowanie genu ludzkiego czynnika transkrypcyjnego GABPA (E4TF1-60) na chromosomie 21”. Genomika . 28 (1): 119–22. doi : 10.1006/geno.1995.1117 . PMID 7590737 .
•    Sawada J, Goto M, Watanabe H, Handa H, Yoshida MC (styczeń 1995). „Regionalne mapowanie dwóch podjednostek czynnika transkrypcyjnego E4TF1 do ludzkiego chromosomu” . Japoński dziennik badań nad rakiem . 86 (1): 10–2. doi : 10.1111/j.1349-7006.1995.tb02981.x . PMC 5920589 . PMID 7737900 .
•    Gugneja S, Virbasius JV, Scarpulla RC (styczeń 1995). „Cztery strukturalnie odrębne, niewiążące DNA podjednostki ludzkiego jądrowego czynnika oddechowego 2 mają wspólną konserwatywną domenę aktywacji transkrypcji” . Biologia molekularna i komórkowa . 15 (1): 102–11. doi : 10.1128/MCB.15.1.102 . PMC 231915 . PMID 7799916 .
•   Maruyama K, Sugano S (styczeń 1994). „Oligo-capping: prosta metoda zastąpienia struktury czapeczki eukariotycznych mRNA oligorybonukleotydami”. gen . 138 (1–2): 171–4. doi : 10.1016/0378-1119(94)90802-8 . PMID 8125298 .
•   Goto M, Shimizu T, Sawada J, Sawa C, Watanabe H, Ichikawa H, Ohira M, Ohki M, Handa H (grudzień 1995). „Przypisanie genu E4TF1-60 do ludzkiego chromosomu 21q21.2-q21.3”. gen . 166 (2): 337–8. doi : 10.1016/0378-1119(95)00575-7 . PMID 8543189 .
•    Sawa C, Goto M, Suzuki F, Watanabe H, Sawada J, Handa H (grudzień 1996). „Domeny funkcjonalne czynnika transkrypcyjnego hGABP beta1 / E4TF1-53 wymagane do lokalizacji jądrowej i aktywacji transkrypcji” . Badania kwasów nukleinowych . 24 (24): 4954–61. doi : 10.1093/nar/24.24.4954 . PMC 146336 . PMID 9016666 .
•   Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (październik 1997). „Konstrukcja i charakterystyka biblioteki cDNA wzbogaconej o pełnej długości i wzbogaconej o koniec 5'”. gen . 200 (1–2): 149–56. doi : 10.1016/S0378-1119(97)00411-3 . PMID 9373149 .
•   Batchelor AH, Piper DE, de la Brousse FC, McKnight SL, Wolberger C (luty 1998). „Struktura GABPalpha / beta: domena ETS - heterodimer powtórzeń ankiryny związany z DNA”. nauka . 279 (5353): 1037–41. Bibcode : 1998Sci...279.1037B . doi : 10.1126/science.279.5353.1037 . PMID 9461436 .
•   Suzuki F, Goto M, Sawa C, Ito S, Watanabe H, Sawada J, Handa H (listopad 1998). „Funkcjonalne interakcje podjednostek białek wiążących czynnik transkrypcyjny ludzkiego GA” . Journal of Biological Chemistry . 273 (45): 29302–8. doi : 10.1074/jbc.273.45.29302 . PMID 9792629 .
•    Itoh K, Wakabayashi N, Katoh Y, Ishii T, Igarashi K, Engel JD, Yamamoto M (styczeń 1999). „Keap1 tłumi jądrową aktywację elementów reagujących na przeciwutleniacze przez Nrf2 poprzez wiązanie z domeną Neh2 na końcu aminowym” . Geny i rozwój . 13 (1): 76–86. doi : 10.1101/gad.13.1.76 . PMC 316370 . PMID 9887101 .
•    Bannert N, Avots A, Baier M, Serfling E, Kurth R (luty 1999). „Czynniki białkowe wiążące GA, w połączeniu z koaktywatorem białka wiążącego CREB / p300, kontrolują indukcję promotora interleukiny 16 w limfocytach T” . Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 96 (4): 1541-6. Bibcode : 1999PNAS...96.1541B . doi : 10.1073/pnas.96.4.1541 . PMC 15509 . PMID 9990060 .
•   Sawada J, Simizu N, Suzuki F, Sawa C, Goto M, Hasegawa M, Imai T, Watanabe H, Handa H (grudzień 1999). „Synergistyczna aktywacja transkrypcji przez hGABP i wybranych członków rodziny białek wiążących czynnik transkrypcji aktywacji / odpowiedzi cAMP” . Journal of Biological Chemistry . 274 (50): 35475–82. doi : 10.1074/jbc.274.50.35475 . PMID 10585419 .
•    Guo A, Nie F, Wong-Riley M (luty 2000). „CDNA podjednostki alfa ludzkiego jądrowego czynnika oddechowego 2: izolacja, subklonowanie, sekwencjonowanie i hybrydyzacja in situ transkryptów w normalnym i pozbawionym jednego oka układzie wzrokowym makaka”. The Journal of Neurology porównawczej . 417 (2): 221–32. doi : 10.1002/(SICI)1096-9861(20000207)417:2<221::AID-CNE7>3.0.CO;2-4 . PMID 10660899 . S2CID 25982934 .
•    Vogel JL, Kristie TM (luty 2000). „Nowy koaktywator C1 (HCF) koordynuje tworzenie wielobiałkowych wzmacniaczy i pośredniczy w aktywacji transkrypcji przez GABP” . Dziennik EMBO . 19 (4): 683–90. doi : 10.1093/emboj/19.4.683 . PMC 305606 . PMID 10675337 .
• Hattori M, Fujiyama A, Taylor TD, Watanabe H, Yada T, Park HS, Toyoda A, Ishii K, Totoki Y, Choi DK, Groner Y, Soeda E, Ohki M, Takagi T, Sakaki Y, Taudien S, Blechschmidt K , Polley A, Menzel U, Delabar J, Kumpf K, Lehmann R, Patterson D, Reichwald K, Rump A, Schillhabel M, Schudy A, Zimmermann W, Rosenthal A, Kudoh J, Schibuya K, Kawasaki K, Asakawa S, Shintani A, Sasaki T, Nagamine K, Mitsuyama S, Antonarakis SE, Minoshima S, Shimizu N, Nordsiek G, Hornischer K, Brant P, Scharfe M, Schon O, Desario A, Reichelt J, Kauer G, Blocker H, Ramser J, Beck A, Klages S, Hennig S, Riesselmann L, Dagand E, Haaf T, Wehrmeyer S, Borzym K, Gardiner K, Nizetic D, Francis F, Lehrach H, Reinhardt R, Yaspo ML (maj 2000).   „Sekwencja DNA ludzkiego chromosomu 21” . Natura . 405 (6784): 311–9. Bibcode : 2000Natur.405..311H . doi : 10.1038/35012518 . PMID 10830953 .
•   Galvagni F, Capo S, Oliviero S (marzec 2001). „Sp1 i Sp3 fizycznie oddziałują i współpracują z GABP w celu aktywacji promotora utrofiny” (PDF) . Dziennik biologii molekularnej . 306 (5): 985–96. doi : 10.1006/jmbi.2000.4335 . hdl : 2318/141203 . PMID 11237613 .
•   Dhakshinamoorthy S, Porter AG (maj 2004). „Indukowana przez tlenek azotu regulacja w górę transkrypcji genów ochronnych przez Nrf2 poprzez element odpowiedzi przeciwutleniającej przeciwdziała apoptozie komórek nerwiaka niedojrzałego” . Journal of Biological Chemistry . 279 (19): 20096–107. doi : 10.1074/jbc.M312492200 . PMID 14985350 .
•   Shen G, Hebbar V, Nair S, Xu C, Li W, Lin W, Keum YS, Han J, Gallo MA, Kong AN (maj 2004). „Regulacja aktywności domeny transaktywacyjnej Nrf2. Zróżnicowane efekty kaskad kinazy białkowej aktywowanej mitogenem i synergistyczny efekt stymulujący białka wiążącego Raf i CREB” . Journal of Biological Chemistry . 279 (22): 23052–60. doi : 10.1074/jbc.M401368200 . PMID 15020583 .

Linki zewnętrzne

• FaktorBook GABP