Homeobox NK2 1

Identyfikatory
NKX2-1
	, Nkx2-1, AV026640, Nkx2.1, T/EBP, Titf1, Ttf-1, BCH, BHC, NK-2, NKX2A, TEBP, TTF1, NMTC1, NK2 homeobox 1 Identyfikatory
zewnętrzne
Lokalizacja genu ( człowiek )
Chr.
Koniec
Lokalizacja genu ( mysz )
Chr.
Koniec
Wzór ekspresji RNA
	; ;
Ontologia genów
Funkcja molekularna
Komponent komórkowy
Proces biologiczny
	Źródła: Amigo / QuickGO
ortologi
	Wikidane
Wyświetl/edytuj człowieka	Wyświetl/edytuj mysz

NK2 homeobox 1 ( NKX2-1 ), znany również jako czynnik transkrypcyjny tarczycy 1 ( TTF-1 ), jest białkiem , które u ludzi jest kodowane przez gen NKX2-1 .

Funkcjonować

Tarczycowy czynnik transkrypcyjny 1 (TTF-1) jest białkiem regulującym transkrypcję genów specyficznych dla tarczycy , płuc i międzymózgowia . Jest również znany jako specyficzne dla tarczycy białko wiążące wzmacniacz. Jest stosowany w patologii anatomicznej jako marker do określenia, czy guz wywodzi się z płuca czy tarczycy. NKX2.1 może być indukowany przez aktywinę A poprzez sygnalizację SMAD2 w modelu różnicowania ludzkich embrionalnych komórek macierzystych.

NKX2.1 jest kluczem do płodowego rozwoju struktur płuc. Grzbietowo-brzuszny wzór ekspresji NKX2.1 tworzy brzuszną granicę w przednim jelicie przednim. NKX2.1 ulega ekspresji tylko w wybranych komórkach ściany brzusznej przedniego jelita i nie ulega ekspresji w ścianie grzbietowej, z której wyłoni się przełyk . Nokaut NKX2.1 u myszy powoduje rozwój skróconej tchawicy , która jest połączona z przełykiem, a oskrzela bezpośrednio łączą tę wspólną rurkę z płucami. Przypomina to całkowitą przetokę tchawiczo-przełykową , która jest rzadką chorobą wrodzoną u ludzi. Ponadto u tych myszy z nokautem nie rozwijają się dystalne struktury płuc. Rozgałęzienia płuc u tych myszy nie występowały poza oskrzelami głównego pnia, w wyniku czego płuca były mniejsze o około 50% w porównaniu z myszami typu dzikiego . nabłonkowy _ wyściółka tych dystalnych struktur nie wykazała różnicowania w wyspecjalizowane komórki. Ta wyściółka składa się z kolumnowych komórek nabłonkowych i rozproszonych rzęskowych komórek nabłonkowych. Proksymalny nabłonek płuc wykazywał normalne zróżnicowanie, co wskazuje, że proksymalne różnicowanie jest niezależne od NKX2.1. NKX2.1 jest początkowo wyrażany w całym nabłonku, ale jest tłumiony w układzie proksymalnym i dystalnym w miarę dalszego rozwoju płuca.

Znaczenie kliniczne

TTF-1 musi mieć barwienie jądrowe w immunohistochemii, aby uznać je za pozytywne. Barwienie cytoplazmy nie jest brane pod uwagę do celów diagnostycznych.

Mikrofotografia gruczolakoraka płuc z przerzutami (znalezionego w mózgu), który wykazuje barwienie jądrowe (brązowe) dla TTF-1 .

Komórki TTF-1 dodatnie znajdują się w płucach jako pneumocyty typu II i komórki klubowe . W tarczycy pęcherzykowe i okołopęcherzykowe są również dodatnie pod względem TTF-1.

W przypadku raka płuc gruczolakoraki są zwykle dodatnie, podczas gdy rak płaskonabłonkowy i rak wielkokomórkowy są rzadko dodatnie. Raki drobnokomórkowe (o dowolnej pierwotnej lokalizacji) są zwykle dodatnie. TTF1 jest czymś więcej niż tylko klinicznym markerem gruczolakoraka płuc. Odgrywa aktywną rolę w podtrzymywaniu komórek raka płuc, biorąc pod uwagę eksperymentalne obserwacje, że jest zmutowany w raku płuc.

Zaobserwowano, że utrata Nkx2-1 umożliwia deregulację czynników transkrypcyjnych FOXA1/2 (poprzez relaksację deacetylacji histonów i represję Foxa1/2 za pośrednictwem metylacji przez Nkx2-1), powodując reaktywację embrionalnego programu różnicowania żołądka w komórkach płucnych. Powoduje to śluzowego gruczolakoraka płuc , źródło złych wyników klinicznych dla pacjentów.

Jednak inni stwierdzili, że barwienie TTF-1 jest często dodatnie w gruczolakorakach płuc, rakach wielkokomórkowych, drobnokomórkowych rakach płuc, guzach neuroendokrynnych innych niż drobnokomórkowy rak płuc i pozapłucnych rakach drobnokomórkowych.

Jest również pozytywny w raku tarczycy i jest używany do monitorowania przerzutów i nawrotów.

Interakcje

Wykazano, że homeoboks 1 NK2 oddziałuje z kalretikuliną i PAX8 .

Dalsza lektura

Lau SK, Luthringer DJ, Eisen RN (czerwiec 2002). „Czynnik transkrypcyjny tarczycy-1: przegląd”. Stosowana immunohistochemia i morfologia molekularna . 10 (2): 97–102. doi : 10.1097/00022744-200206000-00001 . PMID 12051643 .
Guazzi S, Price M, De Felice M, Damante G, Mattei MG, Di Lauro R (listopad 1990). „Czynnik jądrowy tarczycy 1 (TTF-1) zawiera homeodomenę i wykazuje nową specyficzność wiązania DNA” . Dziennik EMBO . 9 (11): 3631–9. doi : 10.1002/j.1460-2075.1990.tb07574.x . PMC 552115 . PMID 1976511 .
Oguchi H, Pan YT, Kimura S (kwiecień 1995). „Pełna sekwencja nukleotydów genu mysiego białka wiążącego wzmacniacz specyficzny dla tarczycy (T / EBP): rozległa identyczność wydedukowanej sekwencji aminokwasów z białkiem ludzkim”. Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Struktura i ekspresja genów . 1261 (2): 304–6. doi : 10.1016/0167-4781(95)00033-D . PMID 7711079 .
Saiardi A, Tassi V, De Filippis V, Civitareale D (kwiecień 1995). „Klonowanie i analiza sekwencji ludzkiego czynnika transkrypcyjnego tarczycy 1”. Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Struktura i ekspresja genów . 1261 (2): 307–10. doi : 10.1016/0167-4781(95)00034-E . PMID 7711080 .
Ikeda K, Clark JC, Shaw-White JR, Stahlman MT, Boutell CJ, Whitsett JA (kwiecień 1995). „Struktura genu i ekspresja ludzkiego czynnika transkrypcyjnego tarczycy-1 w komórkach nabłonka oddechowego” . Journal of Biological Chemistry . 270 (14): 8108–14. doi : 10.1074/jbc.270.44.26460 . PMID 7713914 .
Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB (wrzesień 1996). „Normalizacja i odejmowanie: dwa podejścia ułatwiające odkrywanie genów” . Badania genomu . 6 (9): 791–806. doi : 10.1101/gr.6.9.791 . PMID 8889548 .
Ghaffari M, Zeng X, Whitsett JA, Yan C (grudzień 1997). „Domena lokalizacji jądrowej czynnika transkrypcyjnego tarczycy-1 w komórkach nabłonka oddechowego” . Dziennik biochemiczny . 328 (Pt 3) (3): 757–61. doi : 10.1042/bj3280757 . PMC 1218983 . PMID 9396717 .
Hamdan H, Liu H, Li C, Jones C, Lee M, deLemos R, Minoo P (marzec 1998). „Struktura ludzkiego genu Nkx2.1”. Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Struktura i ekspresja genów . 1396 (3): 336–48. doi : 10.1016/S0167-4781(97)00210-8 . PMID 9545595 .
Perrone L, Powiedz G, Di Lauro R (luty 1999). „Kalretikulina zwiększa aktywność transkrypcyjną czynnika transkrypcyjnego tarczycy-1, wiążąc się z jego homeodomeną” . Journal of Biological Chemistry . 274 (8): 4640–5. doi : 10.1074/jbc.274.8.4640 . PMID 9988700 .
Naltner A, Ghaffari M, Whitsett JA, Yan C (styczeń 2000). „Stymulacja kwasem retinowym ludzkiego promotora białka powierzchniowo czynnego B jest zależna od miejsca czynnika transkrypcyjnego tarczycy 1” . Journal of Biological Chemistry . 275 (1): 56–62. doi : 10.1074/jbc.275.1.56 . PMID 10617585 .
Missero C, Pirro MT, Di Lauro R (kwiecień 2000). „Wiele dalszych szlaków ras pośredniczy w funkcjonalnej represji produktu genu homeobox TTF-1” . Biologia molekularna i komórkowa . 20 (8): 2783–93. doi : 10.1128/MCB.20.8.2783-2793.2000 . PMC85494 . _ PMID 10733581 .
Naltner A, Wert S, Whitsett JA, Yan C (grudzień 2000). „Czasowa / przestrzenna ekspresja koaktywatorów receptorów jądrowych w płucach myszy”. American Journal of Physiology. Fizjologia komórkowa i molekularna płuc . 279 (6): L1066-74. doi : 10.1152/ajplung.2000.279.6.l1066 . PMID 11076796 . S2CID 27872061 .
Yan C, Naltner A, Conkright J, Ghaffari M (czerwiec 2001). „Interakcja białko-białko receptora alfa kwasu retinowego i czynnika transkrypcyjnego tarczycy-1 w komórkach nabłonka oddechowego” . Journal of Biological Chemistry . 276 (24): 21686–91. doi : 10.1074/jbc.M011378200 . PMID 11274148 .
Missero C, Pirro MT, Simeone S, Pischetola M, Di Lauro R (wrzesień 2001). „Glikozylaza DNA tyminy T: G specyficzna dla niedopasowania, glikozylaza DNA hamuje transkrypcję aktywowaną przez czynnik transkrypcyjny tarczycy-1” . Journal of Biological Chemistry . 276 (36): 33569–75. doi : 10.1074/jbc.M104963200 . PMID 11438542 .
Yi M, Tong GX, Murry B, Mendelson CR (styczeń 2002). „Rola CBP / p300 i SRC-1 w regulacji transkrypcji genu białka surfaktantu płucnego-A (SP-A) przez czynnik transkrypcyjny tarczycy-1 (TTF-1)” . Journal of Biological Chemistry . 277 (4): 2997–3005. doi : 10.1074/jbc.M109793200 . PMID 11713256 .
Liu C, Glasser SW, Wan H, Whitsett JA (luty 2002). „GATA-6 i czynnik transkrypcyjny tarczycy-1 bezpośrednio oddziałują i regulują ekspresję genu białka C środka powierzchniowo czynnego” . Journal of Biological Chemistry . 277 (6): 4519–25. doi : 10.1074/jbc.M107585200 . PMID 11733512 .
Ng WK, Chow JC, Ng PK (luty 2002). „Czynnik transkrypcyjny tarczycy-1 jest bardzo czuły i specyficzny w różnicowaniu przerzutowego gruczolakoraka płucnego od gruczolakoraka pozapłucnego w próbkach cytologicznych płynu wysiękowego” . Rak . 96 (1): 43–8. doi : 10.1002/cncr.10310 . PMID 11836702 . S2CID 23626036 .
Pohlenz J, Dumitrescu A, Zundel D, Martiné U, Schönberger W, Koo E, et al. (luty 2002). „Częściowy niedobór czynnika transkrypcyjnego tarczycy 1 powoduje głównie wady neurologiczne u ludzi i myszy” . Dziennik badań klinicznych . 109 (4): 469–73. doi : 10.1172/JCI14192 . PMC 150877 . PMID 11854318 .
Krude H, Schütz B, Biebermann H, von Moers A, Schnabel D, Neitzel H, et al. (luty 2002). „Choreoatetoza, niedoczynność tarczycy i zmiany w płucach spowodowane ludzką haploinsufficiency NKX2-1” . Dziennik badań klinicznych . 109 (4): 475–80. doi : 10.1172/JCI14341 . PMC 150790 . PMID 11854319 .
Miccadei S, De Leo R, Zammarchi E, Natali PG, Civitareale D (kwiecień 2002). „Synergiczne działanie czynnika transkrypcyjnego tarczycy 1 i Pax 8 opiera się na wzajemnym oddziaływaniu promotora / wzmacniacza” . Endokrynologia Molekularna . 16 (4): 837–46. doi : 10.1210/mend.16.4.0808 . PMID 11923479 .

Linki zewnętrzne

TITF1 + białko, + człowiek w US National Library of Medicine Medical Subject Headings (MeSH)

Ten artykuł zawiera tekst z Narodowej Biblioteki Medycznej Stanów Zjednoczonych , która jest własnością publiczną .