białko C7

Białko C7 to zmodyfikowane białko palca cynkowego oparte na mysim ZFP, Zif268 i odkryte przez Wu i in. w 1994 (opublikowane w 1995). Ma ten sam palec cynkowy 2 i palec cynkowy 3 co Zif268, ale różni się sekwencją palca 1. Ma również ten sam cel DNA, 5'-GCGTGGGCG-3'.

Wspólne sekwencje w jednoliterowych kodach aminokwasowych palców 2 i 3 to RSD-H-LTT i RAD-E-RKR (pozycje od -1 do 6 w helisie alfa).

Palec cynkowy 1 ma sekwencję KSA-D-LKR, która zapewnia 13-krotny wzrost powinowactwa do docelowej sekwencji całego ZFP w porównaniu z Zif268.

Jest stosowany w badaniach palca cynkowego, w których sekwencja aminokwasowa palca 2 jest zmieniana w celu określenia odpowiedniej sekwencji do namierzenia danego miejsca docelowego trzech nukleotydów. Preferowana jest odmiana C7, C7.GAT , ponieważ brakuje w niej reszty kwasu asparaginowego obecnej w palcu 3 C7, o której wiadomo, że powoduje zjawisko zwane „nakładanie się miejsc docelowych”. W tym przypadku nakładanie się miejsc docelowych jest wynikiem tworzenia przez resztę kwasu asparaginowego wiązania wodorowego z N4 cytozyny (w nici przeciwnej) sparowanej z zasadą guaniny w podmiejscu palca 2. Może również tworzyć to samo wiązanie wodorowe z zasadą adeniny sparowaną z tyminą. To nakładanie się miejsc docelowych narzucałoby obecność reszty cytozyny lub adeniny jako nukleotyd 3' w podmiejscu palca 2, co jest niedopuszczalne, gdy patrzy się na sekwencje docelowe zawierające inny nukleotyd w tej pozycji.

•    Wu H, Yang WP, Barbas CF (styczeń 1995). „Budowanie palców cynkowych przez selekcję: w kierunku zastosowania terapeutycznego” . proc. Natl. Acad. nauka USA . 92 (2): 344–8. doi : 10.1073/pnas.92.2.344 . PMC42736 . _ PMID 7831288 .