Naziści zniszczyli małe getto 4 października 1941 roku i zabili prawie wszystkich jego mieszkańców w Dziewiątym Forcie . Jeszcze w tym samym miesiącu, 28 października, SS- Rottenführer Helmut Rauca z kowieńskiego gestapo (tajnej policji państwowej) przeprowadził selekcję w kowieńskim getcie . Wszyscy mieszkańcy getta zostali zmuszeni do zgromadzenia się na centralnym placu getta. Rauca wybrał 9200 żydowskich mężczyzn, kobiet i dzieci, czyli około jednej trzeciej populacji getta. Następnego dnia, 29 października, wszyscy ci ludzie zostali rozstrzelani w Dziewiątym Forcie w ogromnych dołach wykopanych z wyprzedzeniem.